Bioinformatique
Genizon a développé une suite de bases de données et d’applications qui intègrent et gèrent l’information tout au long du processus d’identification de gènes, soit de la cueillette d’échantillons et de données cliniques, du génotypage, de l'analyse génétique, de l’identification de gènes et de biomarqueurs jusqu’à la création des cartes géniques GeneMaps.
La plate-forme de Genizon comprend de puissants outils de visualisation de données, dont un fureteur graphique du génome (GBrowse) qui présente des lectures picturales des résultats d’études d’association pangénomique (GWAS), superposées aux gènes et à d’autres caractéristiques du génome humain. GBrowse est un logiciel libre qui a été personnalisé chez Genizon afin d’améliorer sa vitesse, sa variabilité d’échelle, sa robustesse et sa disponibilité, pour permettre la lecture simultanée d’ensembles de données considérables provenant de nombreuses analyses. Genizon a aussi considérablement bonifié GBrowse en y ajoutant des fonctions qui donnent accès à des bases de données à l’interne et à l’externe, qui permettent des requêtes interactives comme le calcul du déséquilibre de liaison (DL) entre des marqueurs spécifiques (essentiel pour localiser les gènes associés aux maladies), et qui affichent la fréquence des haplotypes à risque et protecteurs.
Les réseaux d’interaction protéine-protéine sont identifiés, aidant à expliquer l’architecture des protéomes dans les voies pathologiques. Genizon utilise le logiciel Ingenuity Pathway Analysis, disponible sur le marché, pour aider les scientifiques dans la création des cartes GeneMaps.
Genizon possède aussi d’autres capacités en bioinformatique comme des processus automatisés de téléchargement d’informations à partir de bases de données publiques, le catalogage de gènes dans des régions spécifiques en vue de l’extraction de données, des outils pour faire l’annotation des fonctions présumées de variants génétiques et pour sélectionner les tags SNPs dans une région, des outils automatisés qui permettent de comparer les résultats de plusieurs analyses à la fois, la sélection automatisée de SNPs basée sur le DL, la densité et/ou l’annotation de gènes, et la préparation automatisée des tableaux et des listages de séquences pour les demandes de brevets.